23 đội bóng được chia đều vào 4 bảng theo khu vực địa lý để thi đấu như sau:

• Bảng A: Do Sông Lam Nghệ An đăng cai tổ chức, gồm 6 đội: Sông Lam Nghệ An, Câu lạc bộ Bóng Đá Hà Nội, Than Quảng Ninh, T&T VSH, Vicem Hải Phòng, Viettel.
• Bảng B: Do đoàn bóng đá Thừa Thiên Huế đăng cai tổ chức, gồm 6 đội: Huế, Hà Nội T&T, Nam Định, QNK Quảng Nam, SHB Đà Nẵng, Thanh Hóa.
• Bảng C: Do câu lạc bộ Hoàng Anh Gia Lai đăng cai tổ chức, gồm 5 đội: Hoàng Anh Gia Lai, Bình Định, Campuchia, Đồng Nai, Khatoco Khánh Hòa.
• Bảng D: Do Trung tâm Thể thao Thống Nhất đăng cai tổ chức, gồm 6 đội: Thành phố Hồ Chí Minh, An Giang, Đồng Tâm Long An, TDC Bình Dương, TĐCS Đồng Tháp, XSKT Cần Thơ.

Các đội sẽ thi đấu vòng tròn hai lượt tính điểm, xếp hạng ở mỗi bảng để chọn 8 đội vào thi đấu ở Vòng chung kết, trong đó có 4 đội xếp thứ nhất và 4 đội xếp thứ nhì của 4 bảng.

8 đội xuất sắc lọt vào Vòng chung kết sẽ chia thành 2 nhóm A và B, mỗi nhóm 4 đội thi đấu vòng tròn một lượt, chọn 2 đội đứng đầu mỗi nhóm vào thi đấu Bán kết. Hai đội thua Bán kết đồng xếp Hạng Ba, hai đội thắng bán kết sẽ thi đấu trận Chung kết.[5]